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标题：Seasonal Variation of the Atmospheric Bacterial Community in the Greenlandic High Arctic Is Influenced by Weather Events and Local and Distant Sources

译名：格陵兰北极高纬度大气细菌群落的季节变化受天气事件、局地和远距离来源的影响

作者：Lasse Z Jensen  等

时间：2022-07-08

期刊：Frontiers in microbiology

影响因子：6.064

DOI：10.3389/fmicb.2022.909980

摘要：北极是气候变化的热点，在全球范围内可能产生巨大影响。人们对北极空气中细菌的数量和动态知之甚少，对其季节性变异性知之甚少。研究者于2015年春季和2016年夏季在格陵兰岛东北部的Villum研究站收集了气溶胶样本和湿沉积样本，并使用扩增子测序和qPCR靶向16S rRNA基因来评估DNA和cDNA水平细菌群落的数量和组成。研究发现大气细菌群落存在明显的季节性变化，这可能是由于来源和气象学的变化。早春，大气细菌群落以源自温带和亚北极地区并通过远距离迁移到达采样点的分类群为主。研究者观察到在暴风雪期间气溶胶细菌细胞的有效冲刷，随后在连续4周内大气中细菌浓度非常低。研究者认为这是因为在春末，远距离迁移停止了，仅由冰雪表面组成的局部来源很弱，导致细菌浓度低。观察所得的气溶胶化学成分的变化证实了这一点。在夏季，空气细菌群落仅限于土壤，植物材料和融化的海冰等当地来源。春季雾化和沉积的蓝藻具有很高的活性潜力，这意味着它们在大气或地表雪中的活动。

推荐语：本研究展示了北极高地细菌气溶胶的组成如何在季节性尺度上变化，确定其潜在来源，展示其群落规模如何随时间变化，调查了其多样性并确定其在北极雾霾期间和之后的活动潜力。

标题：Effects of Land Use on the Soil Microbial Community in the Songnen Grassland of Northeast China

译名：不同土地利用方式对松嫩草地土壤微生物群落的影响

作者：Guofu Liu等

时间：2022-07-08

期刊：Frontiers in microbiology

影响因子：6.064

DOI：10.3389/fmicb.2022.865184

摘要：土地利用变化明显改变了草原植物群落组成和土壤性质，从而影响草原生态系统的多种功能和服务。然而，在草地利用类型和相关植被变化过程中，土壤微生物、养分循环的关键驱动因素和其他土壤功能的响应机制尚未得到很好的了解。本研究采用Illumina高通量测序方法分析了东北松嫩平原4种草地利用类型（围封地、割草地、放牧地和农田）土壤微生物群落结构的变化。结果表明，农田和围封地的土壤全氮（TN）显著高于放牧地和割草地，土壤电导率（EC）和pH值较低。相比之下，放牧地和割草地的土壤容重（BD）和有机质分别高于其他土地利用类型。此外，香农多样性和皮耶卢均匀度指数在围封地中最高。基于高通量测序结果，我们在农田中观察到细菌和真菌的α多样性水平很高。结构方程模型（SEM）表明，pH和EC对细菌群落结构和组成具有直接和积极的影响。此外，植物分类多样性（根据香农多样性和皮耶卢均匀度指数）通过土壤pH值和EC间接影响了细菌群落组成，特别是真菌组成与土壤养分直接呈正相关，皮耶卢均匀度指数值随土地利用类型而变化

推荐语：综合本研究的研究结果可知，土壤性质和/或植物多样性可能带动不同草地利用类型土壤微生物群落结构和组成的变化。

标题：Novel Insights into blaGES Mobilome Reveal Extensive Genetic Variation in Hospital Effluents

译名：对blaGES的新研究揭示医院污水中细菌群落的广泛遗传变异

作者：Danieli Conte等

时间：2022-7-26

期刊：Microbiology spectrum

影响因子：9.043

DOI：10.1128/spectrum.02469-21z

摘要：移动遗传元件通过使获得性抗生素耐药性在不同细菌种类和属之间水平转移，有助于多药耐药细菌的出现和传播。本研究描述了bla的遗传骨架特征断续器在气单胞菌属和克雷伯氏菌属中，从未经处理的医院废水中分离出来。使用Illumina和Nanopore平台测序的质粒大小从9到244 kb不等，揭示了质粒不相容性基团IncP6，IncQ1，IncL / M1，IncFII和IncFII-FIA的代表。不同的GES酶（GES-1，GES-7和GES-16）位于Aeronas spp.的新型1类整合素中，而在先前报道的克雷伯氏菌属的1类整合素中，GES-5位于先前报道的1类整合素中。研究结果可知三种气单胞菌分离株呈递GES-1，一种韦罗尼气单胞菌分离出具的 blaGES-7，以及另一种韦罗尼阿氏菌分离株呈递的 blaGES-16.多位点序列分型（MLST）分析揭示了气单胞菌和克雷伯氏菌物种的新序列类型。目前的发现突出了这些物种的巨大遗传多样性，强调了它们对环境的巨大适应性。结果还表明存在公共卫生风险，因为这些抗微生物药物抗性基因有可能到达废水处理厂或体积更大的水体。

推荐语：本研究新发现的物种K. grimontii携带两个带有bla的质粒GES-5，而K. quasipneumoniae携带了两份bla的副本GES-5在同一质粒。这些质粒在临床和自然环境中是细菌多药耐药的主要原因，并且它们含有对临床治疗中至关重要的抗生素的耐药基因，可能导致很大比例的公共卫生问题。

标题：Deciphering the Mechanisms Shaping the Plastisphere Microbiota in Soil

译名：土壤中微塑料菌群形成机制的解析

作者：Yuanze Sun等

时间：2022-07-26

期刊：mSystems

影响因子：7.324

DOI：10.1128/msystems.00352-22

摘要：微塑料的逐渐积累引起了人们对被称为“塑球”的独特利基市场越来越多的关注。本研究旨在表征两种类型微塑料（聚乳酸[PLA]和聚乙烯[PE]）的塑球微生物组，它们在两种不同土壤中的生物降解性不同。孵育60 d后， 在微塑料表面观察到细菌群落α多样性显著降低， 增质层与块状土壤之间的微生物群落组成发生显著差异.温度，而不是聚合物类型，显着诱导了塑性层群落之间的差异。rRNA基因操纵子（rrn）拷贝数在PLA塑性球体中显着较高，表明潜在的降解。共生网络分析表明，PE塑性层比PLA塑性层表现出更大的网络复杂性和更强的稳定性。随机性比表明随机过程对PE和PLA塑球体群落组装具有显著的重要性，而零模型分析表明，确定性过程在形成塑性群落中具有不可忽略的作用。与PE塑球相比，PLA塑球中均质选择的贡献更高，这可能归因于微塑料降解引起的选择压力。

推荐语：本研究结果增强了我们对土壤环境中塑性层多样性模式和组装过程的机制理解，并对微生物生态学和微塑料风险评估具有重要意义。

标题：In Vitro Colonic Fermentation Profiles and Microbial Responses of Cellulose Derivatives with Different Colloidal States

译名：不同胶体状态纤维素衍生物的体外结肠发酵及微生物反应

作者：Xiangxiang He等

时间：2022-07-26

期刊：Journal of agricultural and food chemistry

影响因子：5.895

DOI：10.1021/acs.jafc.2c01721

摘要：虽然纤维素衍生物广泛用于食品工业，但其结构特性对结肠健康的影响尚不清楚。本研究选择了四种类型的纤维素衍生物，包括微晶纤维素（MCC），TEMPO氧化纳米纤维化纤维素（TOCNF），TEMPO氧化纳米晶纤维素（TOCNC）和羧甲基纤维素（CMC）来研究其体外发酵曲线。TOCNF的总短链脂肪酸（SCFAs）产量最高，其次是TOCNC。结果表明，粒径减小和长径比增加改善了不溶性纤维素衍生物的发酵性。MCC和CMC几乎没有发酵，SCFAs的总产量与空白相似。16S rRNA测序显示，纤维素衍生物的发酵导致微生物群落结构的不同。此外，拟杆菌纤维素对利用TOCNF和TOCNC表现出高特异性。

推荐语：本研究结果表明了纤维素衍生物的胶体状态，如大小和溶解度，是控制微生物群落组成和代谢物的重要因素。