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动植物组学Animal and Plant Genomics

真核有参转录组

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产品简介

真核包括真菌和动植物，对于有参考基因组的真核转录组研究，通过计算基因的表达量，揭示其中转录活性较高的相关基因及其功能。另外依据参考基因组，可进行诸如基因覆盖度、测序饱和度等验证性分析；还可进行变剪切分析以及联合miRNA数据进行关联分析等高级分析，能够全面快速的获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息。

产品优势

转录本

检测信号是数字信号，几乎覆盖所有转录本
稀有转录本

在单核苷酸水平对物种的整体转录活动进行检测，能够发现未知转录本和稀有转录本
提取样品

从RNA样品的提取、运输、检测、建库、上机测序等每一个环节进行严格把控

应用领域

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实验流程

Total RNA

mRNA片段化

cDNA合成

文库构建

上机测序

分析流程

样品要求

组织样品

动物组织≥2g；植物组织≥4g；菌液≥2ml(密度约10⁷个/ml，OD600约0.7)，离心除去培养基。可用RNA保护剂(菌体/组织体积:RNAlater=1:5)处理或液氮冻存后保存。

RNA样品

浓度≥50ng/μl，总量≥1μg（单次建库），OD260/280:1.8-2.2，OD260/230≥2.0，RIN值≥6.5，动物28S:18S≥1，植物25S:18S≥1，菌体23S:18S≥1，确保RNA无降解。

cDNA样品

浓度≥10ng/μl，总量≥2μg（单次建库），RIN值≥6.5，OD260/280介于1.8~2.2之间

组织样品

动物组织≥2g；植物组织≥4g；菌液≥2ml(密度约10⁷个/ml，OD600约0.7)，离心除去培养基。可用RNA保护剂(菌体/组织体积:RNAlater=1:5)处理或液氮冻存后保存。

RNA样品

浓度≥50ng/μl，总量≥1μg（单次建库），OD260/280:1.8-2.2，OD260/230≥2.0，RIN值≥6.5，动物28S:18S≥1，植物25S:18S≥1，菌体23S:18S≥1，确保RNA无降解。

cDNA样品

浓度≥10ng/μl，总量≥2μg（单次建库），RIN值≥6.5，OD260/280介于1.8~2.2之间

技术参数

测试策略

HiSeqPE150
数据量

6G~12G
周期

65个工作日