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环境功能基因组Functional Gene Arrays

产品简介

GeoChip 功能基因芯片由国际著名学者,劳伦斯奖(The Ernest Orlando Lawrence Award,2015)获得者周集中(Joe Jizhong Zhou)教授及其团队研发,是环境基因组学研究的一个重大突破。
GeoChip是一种基于全球基因组公共数据库并针对微生物相关的各类功能基因设计特异性的寡核苷酸探针,从而揭示微生物群落功能基因的多样性的高通量宏基因组检测工具。最新的GeoChip 5.0版本涵盖超过570,000种探针,靶向与基础生物地球化学循环、能量代谢及热点研究主题密切相关的2400多种功能基因家族中260,000余种编码基因。该技术作为每年100项最具创新的科学技术发明,荣获美国R&D杂志2009年颁发的R&D 100奖。

产品优势

  • 重复性高

    平行样品间结果重现性高

  • 检测类群广

    涵盖多个功能类别,包括生物地球化学、能量循环、环境胁迫与抗性、有机污染物的生物降解、抗生素抗性及致病性相关的功能、次级代谢以及病毒相关的功能

  • 宿主基因组的干扰少

    GeoChip根据微生物相关的各类功能基因独立设计特异性的探针,极大地降低了特殊样品中动植物宿主基因组对微生物群落功能检测的影响

  • 数据可读性强

    与基于测序的宏基因组数据相比,GeoChip数据简单易懂,可直接用于各类统计分析,有助于结果的解读和比较

实验流程

  • 样品采集

  • 核酸(DNA/RNA)提取

  • 核酸检测

  • 荧光标记

  • 芯片杂交

  • 芯片扫描与成像

分析流程

技术参数

  • 测试策略

    DNA或cDNA

    RNA

  • 数据量

    60K/180K

    60K/180K

  • 周期

    55个工作日

    65个工作日