HuMiChip功能基因芯片是针对人类相关微生物设计的,用于检测人体内(人体相关组织中)微生物群落的功能组成和结构,进而探讨人类健康与微生物群落之间的相互关系的高通量宏基因组检测工具。
该芯片共设计了36,802个探针,涵盖50,007个蛋白编码序列并包含139个关键的基因家族。当中共有25,003个序列特异性探针,可专一地检测单个特定的功能(序列)。该芯片已在人体口腔和肠道微生物群落进行了实验测试,结果表明该芯片能清晰反映正常人群与患有龋齿和牙周炎病人口腔微生物群落与功能结构的差异,从而揭示微生物群落对疾病的响应。
HuMiChip芯片是根据微生物相关的各类功能基因设计的特异性探针,可专一地检测单个特定的功能(序列)
能检测到低至0.001%相对丰度的基因家族,并与第二代测序技术的检测结果相一致
HuMiChip芯片所针对的微生物群落功能十分全面,包括了如氨基酸、碳水化合物、糖、脂类、辅酶、维生素、萜类和聚酮化合物等的代谢与合成相关的微生物
与基于测序的宏基因组数据相比,GeoChip数据简单易懂,可直接用于各类统计分析,有助于结果的解读和比较
样品采集
核酸(DNA/RNA)提取
核酸检测
荧光标记
芯片杂交
芯片扫描与成像
DNA或cDNA
RNA
60K/180K
60K/180K
55个工作日
65个工作日