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微生物组学Microbial Genomics

产品简介

细菌全基因组De novo测序也叫细菌全基因组从头测序,指不依赖于任何参考序列信息就可对某种细菌进行测序,然后用生物信息学的方法进行序列拼接、组装,从而获得该物种的基因组序列图谱,并对其进行结构和功能等一系列的分析。依据研究目标所需精细程度的不同, 我们提供了细菌框架图和细菌完成图两种不同的解决方案。

产品优势

  • 项目周期短

    拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台,可以快速拿到高质量测序结果

  • 测序平台齐全

    拥有多种测序平台,提供最佳的测序解决方案。

  • 分析经验丰富

    拥有专业的生物信息团队和大型计算机,个性化售后分析服务

实验流程

  • 样品采集

  • DNA提取检测

  • 文库构建

  • 文库质检

  • 上机测序

分析流程

技术参数

  • 测试策略


    细菌/古菌框架图:HiSeq PE150(350bp文库)

    细菌/古菌精细图:HiSeq PE250(500bp文库)

    细菌/古菌完成图:PacBio RS II(10kb SMRT文库)






  • 数据量

    细菌/古菌框架图:≥100×

    细菌/古菌精细图:≥100×

    细菌/古菌完成图:≥50×




  • 周期

    细菌/古菌框架图:30个工作日

    细菌/古菌精细图:45个工作日

    细菌/古菌完成图:60个工作日


  • 指标

    细菌/古菌框架图:无

    细菌/古菌精细图:≤30 scaffolds

    细菌/古菌完成图:1contig,0 Gap